Comepte ao Subdirector-Geral do Gabinete Nacional de Segurança (GNS) substituir o Director-Geral nas suas faltas e impedimentos e exercer as competências que por este lhe sejam delegadas ou subdelegadas.
O cargo de Subdirector-Geral do GNS é, actualmente, exercido pelo Capitão-de-Mar-e-Guerra José Manuel Chiotte Lopes da Silva.